鉴定ADH基因家族

在利用 Pfam 数据库鉴定 ADH (醇脱氢酶) 基因家族成员时，主要使用的保守结构域模型是：

核心 Pfam 模型（用于中链 ADH 亚家族）

ADH 家族，特别是植物中常见的中链醇脱氢酶/还原酶 (MDR) 超家族成员，通常包含以下两个关键的 Pfam 结构域：

    PF00107：ADH_zinc_N

        名称： Zinc-binding dehydrogenase, N-terminal domain（锌结合脱氢酶，N 端结构域）

        功能： 这是一个位于蛋白 N 端的结构域，负责锌离子结合，锌离子是 ADH 酶活性位点必需的辅因子。

    PF08240：ADH_N

        名称： Alcohol dehydrogenase GroES-like domain（醇脱氢酶 GroES 样结构域）

        功能： 这是 ADH 的催化结构域之一，具有 GroES 样折叠结构。

其他相关结构域（根据亚家族而异）

ADH 超家族非常庞大，包括短链 (SDR)、中链 (MDR) 和长链 (LDR) 亚家族。在 Pfam 或其他保守结构域数据库中，可能还会搜索到与 ADH 功能相关的结构域：

    NAD(P) 结合结构域： 许多 ADH 酶是 NAD(P)H 依赖的，因此也包含 NAD(P)-结合的 Rossmann 折叠结构域。

    短链 ADH 特有结构域： 如果研究中包含了短链脱氢酶/还原酶 (SDR) 亚家族，则会使用 PF00106 (adh_short，醇脱氢酶，短链型) 等 Pfam 模型。

在鉴定 ADH 基因家族时，通常以 PF00107 和 PF08240 作为主要筛选标准，结合 BLAST 搜索，以确保捕获所有可能的 ADH 家族成员。