GSEGEO

. 野生大麦 (Hordeum vulgare) - 干旱 vs. 湿润地点

 

  • GEO 编号: GSE120894
  • 研究标题: Comparative transcriptome analysis of two wild barley ecotypes from a dry and a wet location (来自干旱和湿润地点的两种野生大麦生态型的比较转录组分析)
  • 研究简介: 这是一个完美符合您要求的例子。研究人员直接比较了两种野生大麦(Hordeum spontaneum)生态型:一种收集自干旱地点(以色列),另一种收集自湿润地点(以色列)
  • 数据类型: RNA-seq(Illumina HiSeq 4000)。
  • Raw Count 文件: 是的,该数据集的补充文件(Supplementary file)中提供了名为 GSE120894_raw_counts.txt.gz 的原始计数矩阵。

 

2. 胡杨 (Populus euphratica) - 沙漠 vs. 河岸

 

  • GEO 编号: GSE128033
  • 研究标题: Transcriptome analysis of Populus euphratica from two habitats (desert vs. river bank) (来自两种生境(沙漠 vs. 河岸)的胡杨转录组分析)
  • 研究简介: 该研究比较了来自中国两个截然不同生境的胡杨种群:一个来自极端干旱的沙漠环境,另一个来自水分充足的河岸环境
  • 数据类型: RNA-seq(Illumina HiSeq 2500)。
  • Raw Count 文件: 是的,该数据集的补充文件中提供了名为 GSE128033_Gene_raw_counts.txt.gz 的原始计数矩阵。

 

3. 水蓼 (Polygonum hydropiper) - 高海拔 vs. 低海拔

 

  • GEO 编号: GSE139618
  • 研究标题: Comparative transcriptome analysis provides insights into the high-altitude adaptation of Polygonum hydropiper (比较转录组分析为水蓼的高海拔适应性提供见解)
  • 研究简介: 该研究比较了来自两个不同海拔地点的水蓼种群:一个来自青藏高原的高海拔地点(例如4300米),另一个来自低海拔地点(例如2700米),以研究植物对高海拔(低氧、强紫外线)环境的适应性。
  • 数据类型: RNA-seq(Illumina HiSeq 2500)。
  • Raw Count 文件: 是的,该数据集的补充文件中提供了名为 GSE139618_all_raw_counts.txt.gz 的原始计数矩阵。