#我已经wget --no-check-certificate -c https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro/iprscan/5/5.60-92.0/lookup_...下载这个lookup
#需要下载对应的interpro
https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/interpro/iprscan/5/5.60-92.0/
#需要验证md5
#怎样使用还没有测试
######下为以前内容
为InterProScan 5.54-87.0版本下载和安装匹配的查询服务的具体步骤:
下载匹配版本的查询服务:
bash
複製
cd /path/to/interproscan
wget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/unix/iprscan/5/lookup_service/lookup_se...
解压安装包:
bash
複製
tar -xvzf lookup_service_5.54-87.0.tar.gz
修改配置文件:
打开配置文件:
bash
複製
vim interproscan.properties
找到并修改以下配置行:
複製
precalculated.match.lookup.service.url=file:///path/to/interproscan/lookup_service
注意:将路径改为你实际解压的lookup_service目录的完整路径
重启InterProScan服务
验证安装:
bash
複製
./interproscan.sh -iprlookup -i test.fasta
注意事项:
确保有足够的磁盘空间(lookup service可能需要几GB空间)
确保下载的版本号完全匹配(5.54-87.0)
路径中不要包含特殊字符和空格
需要更具体的安装细节或遇到问题时,我可以提供进一步的帮助。