SRR解压为fastq流程

#1.登陆111.14.177.46

#2.切换到train用户

su train

#PASSWD与root一样

#3.进入SRR存储目录(以下面的目录为例)

cd /home/train/hd/SRP078467_leaf

#4.拷贝sra2fq.sh脚本

cp /home/train/hd/scripts/sra2fq.sh .

#5. 建立输入和输出文件夹

mkdir -p input

mkdir -p out

#6.input文件夹准备数据

mv SRR122* input

#7.执行脚本

nohup sh sra2fq.sh input out &

# 解压后的fq文件在 out文件夹里

tips:如出现报错,可能是文件夹的权限问题, 执行 sudo  chown -R train:train *  输入root密码