KAAS注释流程

# 8. KAAS 注释
mkdir -p /home/train/13.functional_annotation/08.KAAS
cd /home/train/13.functional_annotation/08.KAAS
# 在 http://www.genome.jp/kaas-bin/kaas_main 网页工具中提交序列进行注释。需要填写邮箱信息，在网页中提交后需要再进入邮箱，点击邮件中的提交链接，才能开始计算。
# Selected organisms: hsa, mmu, rno, dre, dme, cel, ath, sce, cal, spo, ecu, pfa, cho, ehi, eco, nme, hpy, bsu, lla, mge, mtu, syn, aae, mja, ape, sce, dha, ncr, fox, ssl, afm, cpw, bze, tml, uma, mrt, cgi, hir
# 注释完毕后，从填写的邮箱中进入注释完毕后的网页，下载注释结果 query.ko 文件。
#https://www.genome.jp/kaas-bin/kaas_main?mode=user&id=1626238738&key=GdCfKFob
#wget https://www.genome.jp/tools/kaas/files/dl/1689179635/query.ko

cp ~/00.incipient_data/data_for_functional_annotation/query.ko ./
cp ~/00.incipient_data/data_for_functional_annotation/ko00001.keg ./
gene_annotation_from_kaas.pl query.ko > KEGG.txt
cp KEGG.txt ../functional_annotation.KEGG.txt
cd ..