我们的生信博客-QFNU

#打开cygwin

ssh train@10.31.23.13

输入密码

#常用命令

cd     

ls

less 

less -S

cp

rm

#退出服务器

logout

#清屏

clear

#在win系统下cygwin切换盘

cd /cygdrive/D

ls

less 

是的，可以通过 Apache 配置文件来实现将 http://10.26.13.151/blast 重定向到 http://10.26.13.151:7777。有几种方法可以实现这个目标，具体取决于你的需求和 Apache 配置。

方法 1：使用 Apache 的 ProxyPass 和 ProxyPassReverse

ProxyPass 和 ProxyPassReverse 指令允许你将一个路径的请求转发到另一个端口或主机上。对于你的情况，你可以设置 Apache 将对 /blast 路径的请求转发到 7777 端口。

配置步骤：

1. 打开 Apache 配置文件（通常是 httpd.conf 或你虚拟主机的配置文件）。
2. 在配置文件中添加如下内容：

apache

複製程式碼

#1.在登陆端（笔记本）

ssh-keygen -R  IPADDRESS

#2.在远程服务器端

• SSH 服务未运行：
  • 确认目标服务器上的 SSH 服务是否正在运行：
    sudo systemctl status sshd
• 防火墙或安全组限制：
  • 检查目标服务器的防火墙规则或安全组是否阻止了 SSH 连接：
    sudo firewall-cmd --list-all
  • 确保开放了端口 22（SSH 默认端口）：
    sudo firewall-cmd --permanent --add-port=22/tcp
  • sudo firewall-cmd --reload

#dnf updat

###这不要做sudo dnf update -y

#centos8的软件仓库没有phpMyAdmin,从官方下载

wget https://www.phpmyadmin.net/downloads/phpMyAdmin-latest-all-languages.tar.gz
#解压文件并移动到Apache默认目录

tar -xvf phpMyAdmin-latest-all-languages.tar.gz

rm phpMyAdmin-latest-all-languages.tar.gz -f
sudo mv phpMyAdmin-*-all-languages /usr/share/phpMyAdmin
#设置文件权限

sudo chown -R apache:apache /usr/share/phpMyAdmin
sudo chmod -R 755 /usr/share/phpMyAdmin
#配置Apache

####测试！初步success

#在/var/www/html/Artocarpus/JBrowse-1.16.11目录下执行

bin/prepare-refseqs.pl --fasta /opt/download/genomeData/FE/FE.genome.fasta --out ArtocarpusData/json/FE

bin/flatfile-to-json.pl --out ArtocarpusData/json/FE --gff /opt/download/genomeData/FE/FE.gff3 --type mRNA --autocomplete all --trackLabel genes --key 'Gene models' --getSubfeatures --className transcript --trackType CanvasFeatures --subfeatureClasses '{"CDS": "transcript-CDS", "exon": "hidden"}' --arrowheadClass arrowhead

#浏览器显示

#########maiaDB中先建好用户，数据库；表格的设置采用“utf8mb4"

#####1.创建表格

CREATE TABLE mogu (

ID VARCHAR(15) NOT NULL,

GroupLatin VARCHAR(100) CHARACTER SET utf8mb4,

GroupCHN VARCHAR(100) CHARACTER SET utf8mb4,

LatinName VARCHAR(255) CHARACTER SET utf8mb4,

CHNName VARCHAR(255) CHARACTER SET utf8mb4,

ItName VARCHAR(255) CHARACTER SET utf8mb4,

Morphology TEXT CHARACTER SET utf8mb4,

Surroundings TEXT CHARACTER SET utf8mb4,

Habitat TEXT CHARACTER SET utf8mb4,

Url VARCHAR(255) CHARACTER SET utf8mb4,

发表于2019 年 4 月 1 日

1. 简介

现在NCBI不再提供wwwblast软件下载。且NCBI的wwwblast软件很久没更新，界面简陋，因此不推荐使用该软件进行本地化blast分析。使用SequenceServer部署本地化blast网页服务，界面简单易用，还可以同时勾选多个数据库进行比对分析。以下讲解使用Sequenceserver在Rocky 9.2 Linux系统上搭建本地化blast网页服务。

2. 安装软件

如下：

0.基因课软件下载地址

http://ftp.genek.cn:8888/Share/linux_software/

1. 日本FTP

http://ftp.gen-info.osaka-u.ac.jp/biosoft/blast/executables/release/2.2.9/

2.

https://ftp.gnu.org/gnu/grub/

3. 国际生物学数据库镜像 网站

http://ftp.cbi.pku.edu.cn

#HTTP

欧洲基因组数据库

联系我
hisunpeng@qfnu.edu.cn