perl/cgi构建现代生物信息学数据库网站的思路

具体建议

对于生物信息学网站,我建议:

  1. 跳过FrontPage,直接学习Bootstrap基础
  2. 使用现成模板,如SB Admin、AdminLTE的科学主题版本
  3. 专注核心功能:序列分析、数据可视化、结果导出
  4. 采用渐进式开发:先实现核心功能,再逐步美化

学习路径:

HTML5基础 → Bootstrap框架 → jQuery基础 →
Perl/CGI开发 → 数据可视化 → 用户体验优化

 

方案一:模板驱动开发(推荐)

1. 选择现成的生物信息学网站模板
- Bootstrap生物主题模板
- AdminLTE等后台管理模板

2. 直接基于HTML5 + Bootstrap框架
- 响应式设计
- 现代化组件
- 良好的浏览器兼容性

前端技术学习和总结

0.菜鸟教程

https://www.cainiaojc.com/
了解html5 css3 bootstrap

Hbuider

1.过时的,建议不学淘汰的,可以快速设计表格和index
Frontpage
Dreamweaver cs6

2.使用Bootstrap/jQuery
Bootstrap Studio

对于生物信息学网站,我建议:

  1. 跳过FrontPage,直接学习Bootstrap基础
  2. 使用现成模板,如SB Admin、AdminLTE的科学主题版本
  3. 专注核心功能:序列分析、数据可视化、结果导出
  4. 采用渐进式开发:先实现核心功能,再逐步美化

学习路径:

 

 

利用d3.js做差异表达火山图

<html>

 
<head>

 
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">

 
<meta name="Keywords" content="mouse">

 
<meta name="Description" content="genomic database">

 
<link href="../../MouseOmics/css/dropdown.css" rel="stylesheet" type="text/css">

隐藏cgi网站的所有.cgi扩展名方法

在Perl/CGI创建的网站中,实现不显示.cgi扩展名的URL(如BlockDetail?而不是BlockDetail.cgi?),有几种常见方法:

方法1:Apache URL重写(推荐)

在网站根目录创建或修改.htaccess文件:

apache

RewriteEngine On

# 隐藏.cgi扩展名
RewriteRule ^cgi-bin/mousePortal/BlockDetail$ /cgi-bin/mousePortal/BlockDetail.cgi [L]
RewriteRule ^cgi-bin/mousePortal/BlockDetail\?(.*)$ /cgi-bin/mousePortal/BlockDetail.cgi?$1 [L]

# 或者更通用的规则 - 隐藏所有.cgi扩展名
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME}\.cgi -f
RewriteRule ^(.+)$ $1.cgi [L]

完整的.htaccess示例

apache

关于database论文自查和AIGC将AI方法

一、自查问题,思考解决,有备无患

1.Site search的perl程序是不是需要重新写?
2.Expression的各个PRJNA是不是需要建立超链接,并且著名SRA等各个项目,各个实验的号
3.差异表达分析???
4.Annotation search里面添加一些有KOG 或者 eggNOG注释的基因
5.检查写作中的问题

  •  5.1标点符号
  •  5.2括号的使用
  •  5.3简写用
  •  5.4斜体的使用
  •  5.5引号的使用

二、降低AIGC

2.0.0、引言

            -在使用AI时,提示词“包含个人反思和不完美表达,避免重复词汇,使用Flesch阅读易度60分的自然语言”

            -使用humanize关键词在提示中

几个重要的生信cgi网站

1

https://yanglab.qd.sdu.edu.cn/Q-BioLiP/
山东大学团队,杨建益团队

2
http://plantcrispr.org/cgi-bin/crispr/index.cgi
一个纯粹的cgi网站,NSF国外

3
https://oncodb.org/
肿瘤表达量cgi网站,华人国外

4https://bioinfo-minzhao.org/soft/lcgene/
cgi关于肺癌的网站,页面可以参考

 

5

ka/ks计算和正选择分析英文写作及方法

0建树
 

Phylogeny of tomato accessions

另一个vpn翻墙科学上网地址

1.飞兔云

飞兔云
https://飞兔.com

 

2.VeeeVPN
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接收基因组数据库的低分期刊

International Journal of Genomics  IF2.7

能发数据库的一区期刊

Journal of Genetics and Genomics  JCC  中科院一区

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