我们的生信博客-QFNU

KEGG富集分析CGI脚本换行符处理问题技术报告

📋 问题概述

问题描述

用户在KEGG富集分析工具的文本框中使用换行符分隔输入多个基因ID时，系统只能识别和处理第一个基因ID，导致富集分析结果不完整或失败。

影响范围

• 用户体验： 用户无法通过换行符方式批量输入基因ID
• 功能完整性： 前端声明支持换行符，但后端实际不支持
• 数据准确性： 分析结果只基于部分输入数据

系统环境

• 语言： Perl CGI
• Web服务器： Apache
• 操作系统： Linux
• 用户界面： HTML表单 + JavaScript

🔍 详细问题分析

1. 问题表现

用户输入示例

• 新建会话：

  tmux

• 退出会话：

  exit # 或按 `Ctrl + D`

• 分离会话（保持后台运行）：

  Ctrl + B → D # 按组合键后松开，再按 D

窗格（Pane）管理

操作
快捷键

水平分割窗格
Ctrl + B → "

垂直分割窗格
Ctrl + B → %

切换窗格
Ctrl + B → 方向键

关闭当前窗格
Ctrl + D

全屏当前窗格
Ctrl + B → Z

展开思考过程

在 Cygwin 中设置无密码登录服务器（基于 SSH 密钥认证），需通过以下步骤完成：

1. 生成 SSH 密钥对

在 Cygwin 终端中执行以下命令生成密钥对（推荐使用 Ed25519 算法）：

ssh-keygen -t ed25519 -C "your_email@example.com"

• 按提示选择密钥保存路径（默认：\\~/.ssh/id_ed25519）
• 直接回车跳过设置密码（实现无密码登录）

2. 上传公钥到服务器

方法一：使用 ssh-copy-id（推荐）

ssh-copy-id -i \\~/.ssh/id_ed25519.pub username@server_ip

• 输入服务器密码完成上传
• 若提示命令不存在，需先安装 OpenSSH 客户端：apt-cyg install openssh

方法二：手动复制公钥

一 备份一个表（包括表结构和内容）
 

完全备份表（表结构+数据）

方法1: 使用mysqldump命令（推荐）

# 备份单个表（包含表结构和数据）
mysqldump -u用户名 -p密码 数据库名 表名 > 备份文件名.sql

# 示例
mysqldump -uroot -p123456 mydatabase users > users_backup.sql

# 如果需要备份多个表
mysqldump -uroot -p123456 mydatabase table1 table2 table3 > tables_backup.sql

# 只备份表结构（不含数据）
mysqldump -u用户名 -p密码 --no-data 数据库名 表名 > 表结构.sql

# 只备份数据（不含表结构）
mysqldump -u用户名 -p密码 --no-create-info 数据库名 表名 > 表数据.sql

方法2: 使用SQL语句备份

193     # 获取页眉HTML和CSS样式

win10搜索store进入windows应用商店

https://apps.microsoft.com/detail/9wzdncrfhvjl?hl=en-US&gl=US  （可以下载onenote for win10)

解决了猎豹浏览器的兼容性问题。

总结我们解决的问题：

✅ 解决了服务器错误

• 移除了导致Perl语法错误的@media查询
• 避免了变量重复声明问题

✅ 解决了猎豹浏览器兼容性

• 添加了强制CSS属性设置SVG尺寸
• 使用了-webkit-transform: translateZ(0)触发硬件加速
• 添加了JavaScript延迟修复确保SVG正确渲染

✅ 确保了跨浏览器兼容

• 谷歌浏览器：正常显示
• 猎豹浏览器：现在也能显示完整内容

当前的最终解决方案：

css

Perl 脚本 syntenyTool.pl，使用 mcscanx_tripal 功能，但出现了错误：[ERR]Chr13 Chr13。

让我分析一下代码中的 mcscanx_tripal 函数，看看这个错误是从哪里来的。

在 mcscanx_tripal 函数中，我看到了这行代码：（尝试替换$o =~ s/_.*$//;)

一、AI率检测机制与风险

1. 检测原理
   当前主流的AIGC检测系统（如知网、Turnitin、iThenticate）通过分析文本的困惑度（Perplexity）、突发性（Burstiness）及语言模式识别AI生成内容。AI生成的文本通常具有结构规整、连接词机械、术语堆砌等特点

   CSDN博客

   • 安全阈值：多数高校要求AI率低于20%-30%，部分期刊（如Elsevier）对关键章节（如讨论部分）的AI痕迹容忍度更低

   高风险特征：长句、排比结构、“首先/其次/因此”等固定连接词、缺乏个性化表达或数据支撑。

二、降低AI率的核心方法

1. 人工改写与优化

当EndNote中出现相同文献的重复条目（标记为a、b等），可以通过以下方法解决：

方法一：查找重复文献功能

1. 在EndNote中选择 References → Find Duplicates
2. EndNote会自动识别重复文献并显示
3. 选择要保留的版本，删除重复的条目

方法二：手动处理

1. 在文献库中找到重复的两条记录
2. 比较两条记录的完整性和准确性
3. 保留信息更完整、更准确的那一条
4. 删除另一条记录

方法三：合并重复条目

1. 选中两条重复文献
2. 右键选择 References → Merge Duplicates
3. EndNote会将信息合并到一条记录中