Submitted by admin on Tue, 05/20/2025 - 11:57
Submitted by admin on Tue, 05/20/2025 - 02:15
The tomatoPangenome provides user-friendly interfaces and search functions, as well as customized third-party tools, such as BLAST and JBrowse, to help users extract interesting information of genomic data in tomato individuals. All data in tomatoPangenome are freely available and will be updated regularly with newly generated shrimp reference genomes.
Submitted by admin on Tue, 05/20/2025 - 01:50
1.关于物种名-可以实现点击种名，同时默认填写属+种名（是因为填写在js中设置的值）
<td> <input class="selectstyle" type="text" name="speciesid" size="50"> eg: <a href="javascript:void(0)" OnClick="assignValue()"><i>Artocarpus</i></a>, <a href="javascript:void(0)" OnClick="assignValue1()"><i>nanchuanensis</i></a>.</td>
#同时在javascript/query.js中有
Submitted by admin on Sun, 05/18/2025 - 10:28
/tmp/systemd-private-5f77d1e843c74622a505836ba6e34fa5-httpd.service-GCZEVi/tmp
Submitted by admin on Sun, 05/18/2025 - 10:26
为Batch Search添加了一个下载按钮
文件临时存储在
/opt/download/batchDownload
注意定时清理
Submitted by admin on Sun, 05/18/2025 - 10:24
1.注意后台的pathway_SP.pl可以设置生成的富集通路图，目前设置为2
2.程序调用命令
perl pathview_SP.pl --cpu 4 --kokeg ko00001.keg functional_annotation.KEGG.txt ../pppppp
默认是采用了四线程，根据服务器性能可以做出调整
Submitted by admin on Sat, 05/17/2025 - 15:22
<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
<meta name="Keywords" content="Artocarpus, GO enrichment">
<meta name="Description" content="ArtocarpusGD, Artocarpus, GO enrichment analysis">
<script type="text/javascript" src="javascript/query.js"></script>
<script type="text/javascript" src="javascript/logoLink.js"></script>
<link href="css/buttonstyle.css" rel="stylesheet" type="text/css">
Submitted by admin on Sat, 05/17/2025 - 13:39
问题分析
- 表格间距(cellspacing)设置不同:
- JBrowse.htm: 外层和中层表格使用cellspacing="15px"，内层表格使用cellspacing="10px"
- Version2: 所有表格统一使用cellspacing="20px"，这导致了更大的间距
- 表格内容结构:
- JBrowse.htm在内层表格结束后使用了 ，可能影响了元素间的紧凑度
- Version2的表格行高和单元格间距更大
Submitted by admin on Sat, 05/17/2025 - 03:00
修改方案：给网页添加 Home 和 Image 选项卡并实现框架内加载
分析了您的 Perl CGI 代码，我发现这是一个展示基因组信息的网页，现在需要添加新的导航选项并实现在同一框架内加载内容。
修改思路
- 在现有导航栏左侧添加 Home 和 Image 链接
- 使用 iframe 或 JavaScript 实现在同一页面内加载内容，保持顶部导航栏不变
- 确保 Home 链接能够返回主页
实施方案
第一部分：修改导航链接
找到代码中的这一部分（出现在两个地方）：
perl
Submitted by admin on Fri, 05/16/2025 - 13:33
1.文件
/var/www/html/下有 primer3web_input.htm primer3web_help.htm
/var/www/cgi-bin/下有
primer3_core
primer3web_help.cgi
primer3web_results.cgi
todrep_and_simple.txt human等四个txt文件
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